Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms