Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms