Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms