Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms