Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms