Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 Z97985.1-201ENST00000332270 946 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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