Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms