Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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IRF4Q15306 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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IRF4Q15306 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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IRF4Q15306 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
IRF4Q15306 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
IRF4Q15306 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
IRF4Q15306 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
IRF4Q15306 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
IRF4Q15306 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
IRF4Q15306 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
IRF4Q15306 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
IRF4Q15306 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
IRF4Q15306 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRF4Q15306 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRF4Q15306 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRF4Q15306 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRF4Q15306 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRF4Q15306 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRF4Q15306 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRF4Q15306 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRF4Q15306 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRF4Q15306 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRF4Q15306 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRF4Q15306 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRF4Q15306 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRF4Q15306 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRF4Q15306 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRF4Q15306 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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