Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms