Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IHHQ14623 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IHHQ14623 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IHHQ14623 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
IHHQ14623 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
IHHQ14623 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
IHHQ14623 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IHHQ14623 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IHHQ14623 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IHHQ14623 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IHHQ14623 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms