Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SPIDRQ14159 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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