Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms