Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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