Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms