Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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PMS2P11Q13670 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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PMS2P11Q13670 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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PMS2P11Q13670 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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PMS2P11Q13670 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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PMS2P11Q13670 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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PMS2P11Q13670 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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PMS2P11Q13670 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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PMS2P11Q13670 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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PMS2P11Q13670 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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