Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms