Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 AC010487.2-201ENST00000594546 486 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 AC027644.3-201ENST00000607978 557 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 AP000345.2-201ENST00000608615 1081 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 ANP32E-203ENST00000436748 1339 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 AC006355.1-201ENST00000440982 1012 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 AL133330.1-201ENST00000510619 704 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2BQ13554 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms