Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms