Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R2Q13319 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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