Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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