Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TROQ12816 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TROQ12816 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TROQ12816 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TROQ12816 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TROQ12816 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TROQ12816 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TROQ12816 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TROQ12816 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
TROQ12816 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TROQ12816 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TROQ12816 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
TROQ12816 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TROQ12816 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TROQ12816 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
TROQ12816 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TROQ12816 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TROQ12816 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TROQ12816 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TROQ12816 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
TROQ12816 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
TROQ12816 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TROQ12816 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TROQ12816 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TROQ12816 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TROQ12816 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TROQ12816 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TROQ12816 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TROQ12816 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TROQ12816 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TROQ12816 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TROQ12816 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TROQ12816 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TROQ12816 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TROQ12816 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TROQ12816 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TROQ12816 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TROQ12816 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TROQ12816 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TROQ12816 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TROQ12816 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TROQ12816 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TROQ12816 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TROQ12816 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TROQ12816 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TROQ12816 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TROQ12816 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TROQ12816 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TROQ12816 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TROQ12816 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TROQ12816 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TROQ12816 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TROQ12816 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TROQ12816 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TROQ12816 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TROQ12816 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TROQ12816 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TROQ12816 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TROQ12816 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TROQ12816 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TROQ12816 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TROQ12816 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TROQ12816 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TROQ12816 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TROQ12816 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TROQ12816 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TROQ12816 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TROQ12816 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TROQ12816 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TROQ12816 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TROQ12816 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TROQ12816 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TROQ12816 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TROQ12816 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TROQ12816 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TROQ12816 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TROQ12816 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TROQ12816 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TROQ12816 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TROQ12816 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TROQ12816 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TROQ12816 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TROQ12816 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TROQ12816 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TROQ12816 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TROQ12816 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TROQ12816 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TROQ12816 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TROQ12816 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TROQ12816 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TROQ12816 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TROQ12816 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TROQ12816 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TROQ12816 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TROQ12816 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TROQ12816 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TROQ12816 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TROQ12816 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TROQ12816 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TROQ12816 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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