Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms