Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms