Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FMODQ06828 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FMODQ06828 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FMODQ06828 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FMODQ06828 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FMODQ06828 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FMODQ06828 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FMODQ06828 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FMODQ06828 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FMODQ06828 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FMODQ06828 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FMODQ06828 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FMODQ06828 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FMODQ06828 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FMODQ06828 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FMODQ06828 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FMODQ06828 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FMODQ06828 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FMODQ06828 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FMODQ06828 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FMODQ06828 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FMODQ06828 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FMODQ06828 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FMODQ06828 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FMODQ06828 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FMODQ06828 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FMODQ06828 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FMODQ06828 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FMODQ06828 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FMODQ06828 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FMODQ06828 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FMODQ06828 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FMODQ06828 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FMODQ06828 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FMODQ06828 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FMODQ06828 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FMODQ06828 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms