Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms