Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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EFNB1P98172 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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