Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.9 ms