Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD3P84022 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms