Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 GADL1-201ENST00000282538 3759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 ZNF502-203ENST00000436624 2314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 KLK2-202ENST00000358049 2847 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 SLC39A13-204ENST00000524928 3553 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 NDRG4-204ENST00000394282 3626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 ZIC3-201ENST00000287538 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 MAP7-208ENST00000617204 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 MAK16-201ENST00000360128 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX1P83916 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 DBIL5P-203ENST00000536214 2677 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 LITAF-221ENST00000622633 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms