Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTRA4P83105 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms