Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMF1P82094 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMF1P82094 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMF1P82094 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMF1P82094 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMF1P82094 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMF1P82094 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMF1P82094 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMF1P82094 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMF1P82094 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMF1P82094 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMF1P82094 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMF1P82094 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMF1P82094 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMF1P82094 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMF1P82094 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMF1P82094 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMF1P82094 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMF1P82094 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMF1P82094 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMF1P82094 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMF1P82094 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMF1P82094 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMF1P82094 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMF1P82094 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMF1P82094 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMF1P82094 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMF1P82094 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMF1P82094 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMF1P82094 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMF1P82094 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMF1P82094 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMF1P82094 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMF1P82094 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMF1P82094 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMF1P82094 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMF1P82094 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMF1P82094 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms