Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms