Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTBP60709 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTBP60709 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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ACTBP60709 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTBP60709 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTBP60709 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTBP60709 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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ACTBP60709 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTBP60709 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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ACTBP60709 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTBP60709 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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ACTBP60709 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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ACTBP60709 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTBP60709 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTBP60709 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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ACTBP60709 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTBP60709 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTBP60709 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTBP60709 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTBP60709 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTBP60709 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTBP60709 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTBP60709 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTBP60709 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTBP60709 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTBP60709 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTBP60709 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTBP60709 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTBP60709 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTBP60709 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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