Protein–RNA interactions for Protein: P55899

FCGRT, IgG receptor FcRn large subunit p51, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCGRTP55899 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FCGRTP55899 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms