Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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