Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms