Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms