Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNA2P51530 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNA2P51530 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNA2P51530 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNA2P51530 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNA2P51530 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNA2P51530 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNA2P51530 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNA2P51530 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNA2P51530 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNA2P51530 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNA2P51530 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNA2P51530 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNA2P51530 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNA2P51530 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNA2P51530 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNA2P51530 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNA2P51530 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNA2P51530 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DNA2P51530 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNA2P51530 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNA2P51530 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNA2P51530 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNA2P51530 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNA2P51530 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNA2P51530 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNA2P51530 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNA2P51530 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNA2P51530 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNA2P51530 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNA2P51530 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNA2P51530 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNA2P51530 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNA2P51530 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNA2P51530 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNA2P51530 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNA2P51530 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNA2P51530 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNA2P51530 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNA2P51530 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNA2P51530 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNA2P51530 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNA2P51530 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNA2P51530 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DNA2P51530 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNA2P51530 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNA2P51530 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNA2P51530 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNA2P51530 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNA2P51530 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DNA2P51530 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNA2P51530 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DNA2P51530 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNA2P51530 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNA2P51530 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNA2P51530 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNA2P51530 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNA2P51530 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNA2P51530 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNA2P51530 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNA2P51530 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DNA2P51530 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DNA2P51530 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DNA2P51530 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DNA2P51530 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DNA2P51530 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DNA2P51530 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DNA2P51530 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNA2P51530 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNA2P51530 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNA2P51530 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNA2P51530 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNA2P51530 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNA2P51530 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNA2P51530 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNA2P51530 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNA2P51530 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNA2P51530 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNA2P51530 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNA2P51530 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DNA2P51530 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNA2P51530 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNA2P51530 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNA2P51530 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNA2P51530 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNA2P51530 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNA2P51530 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNA2P51530 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNA2P51530 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNA2P51530 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNA2P51530 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNA2P51530 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNA2P51530 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNA2P51530 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNA2P51530 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DNA2P51530 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNA2P51530 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNA2P51530 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNA2P51530 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DNA2P51530 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms