Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms