Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA8P48165 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA8P48165 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA8P48165 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA8P48165 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA8P48165 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA8P48165 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA8P48165 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA8P48165 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA8P48165 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA8P48165 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA8P48165 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA8P48165 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA8P48165 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA8P48165 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA8P48165 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA8P48165 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms