Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PBX2P40425 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PBX2P40425 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PBX2P40425 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 NOVA1-209ENST00000547619 947 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBX2P40425 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms