Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DUSP1P28562 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms