Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPREP23469 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPREP23469 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPREP23469 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPREP23469 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPREP23469 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPREP23469 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPREP23469 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPREP23469 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPREP23469 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPREP23469 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms