Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms