Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP2A2P16615 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms