Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRAFP15056 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRAFP15056 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRAFP15056 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BRAFP15056 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRAFP15056 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BRAFP15056 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRAFP15056 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRAFP15056 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRAFP15056 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRAFP15056 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRAFP15056 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRAFP15056 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRAFP15056 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRAFP15056 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRAFP15056 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRAFP15056 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRAFP15056 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRAFP15056 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRAFP15056 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRAFP15056 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRAFP15056 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRAFP15056 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRAFP15056 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BRAFP15056 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRAFP15056 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRAFP15056 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRAFP15056 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRAFP15056 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRAFP15056 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRAFP15056 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BRAFP15056 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRAFP15056 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRAFP15056 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRAFP15056 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRAFP15056 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRAFP15056 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRAFP15056 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRAFP15056 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRAFP15056 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRAFP15056 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRAFP15056 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRAFP15056 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRAFP15056 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRAFP15056 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BRAFP15056 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BRAFP15056 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRAFP15056 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRAFP15056 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRAFP15056 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRAFP15056 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRAFP15056 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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