Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms