Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG7O95352 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG7O95352 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG7O95352 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG7O95352 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG7O95352 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG7O95352 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG7O95352 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG7O95352 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG7O95352 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG7O95352 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG7O95352 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG7O95352 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG7O95352 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG7O95352 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG7O95352 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG7O95352 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG7O95352 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG7O95352 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG7O95352 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG7O95352 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG7O95352 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG7O95352 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG7O95352 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG7O95352 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG7O95352 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG7O95352 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG7O95352 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG7O95352 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG7O95352 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG7O95352 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG7O95352 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG7O95352 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG7O95352 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG7O95352 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG7O95352 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG7O95352 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms