Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 ZNF773-205ENST00000599847 5832 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 KCNA1-201ENST00000382545 7997 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 RAP1A-202ENST00000369709 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 FCRLA-206ENST00000367949 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 CEP68-201ENST00000260569 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 FAM196A-201ENST00000424811 3149 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 LIMCH1-213ENST00000511496 3439 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 IKZF4-203ENST00000547167 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 ASB7-201ENST00000332783 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 BLZF1-201ENST00000329281 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 JDP2-203ENST00000435893 5401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 MAST4-202ENST00000403625 10711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNAPINO95295 DNMT3A-202ENST00000321117 4279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SNAPINO95295 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SNAPINO95295 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SNAPINO95295 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SNAPINO95295 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SNAPINO95295 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SNAPINO95295 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SNAPINO95295 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SNAPINO95295 MZF1-AS1-202ENST00000600534 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SNAPINO95295 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SNAPINO95295 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SNAPINO95295 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SNAPINO95295 PNPLA7-202ENST00000406427 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms