Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms